Koiran ja suden risteymien tunnistamiseen on kehitetty uusi menetelmä - osoitti vanhan DNA-analyysimenetelmän puutteen

29.04.2021

wolf-635063_640.jpg

Kuvassa susi. Kuva: kuvituskuva

Oulun yliopiston johtamassa kansainvälisessä hankkeessa on kehitetty menetelmä, jolla voidaan tunnistaa aikaisempaa tarkemmin koiran ja suden risteymät. Kehitystyö toi esiin kaksi suden ja koiran risteymää, jotka vanhalla menetelmällä oli määritelty susiksi.

Aikaisemman tutkimustiedon perusteella aiemmin käytetty analyysimenetelmä tunnistaa koirasudet susista ensimmäisessä ja toisessa polvessa. Mitä useamman polven takaisinristeymästä puhutaan, sitä epävarmemmaksi muuttuu lajin tunnistaminen vanhalla menetelmällä. Nyt tehdyn uuden koirasusipaneelin tulos osoittaa, että myös toisen polven risteymien tunnistamisessa voi esiintyä haasteita, jos käytetään pelkästään mikrosatelliittianalyysiä.

- Kehitystyöhön lähdettiin, koska risteymien tunnistamista varten haluttiin kehittää menetelmä, jota voidaan käyttää koko Euroopan laajuisesti. Vanhaan menetelmään verrattuna uusi menetelmä on nopeampi, kustannustehokkaampi ja eri laboratorioissa tehdyt analyysit ovat keskenään vertailukelpoisia. Vanhalla menetelmällä eri laboratorioissa saatuja risteymäanalyysien tuloksia ei voi vertailla suoraan keskenään, kertoo tutkimuksessa mukana ollut Oulun yliopiston väitöskirjatutkija, maaliskuusta alkaen Lukessa työskennellyt, Jenni Harmoinen.

Luonnonvarakeskus Luke lähetti Oulun yliopiston tutkimukseen DNA-näytteitä tunnetuista koirasusista. Lisäksi tutkimuksessa oli mukana DNA-näytteet kahdesta eläimestä, jotka oli aiemmassa Turun yliopiston analyysissä määritelty susiksi, mutta joiden DNA-tulos poikkesi keskimääräisestä sudesta. Näytteet haluttiin ottaa uudelleen tarkasteluun koirasusien tarkempaan tunnistamiseen kehitetyllä menetelmällä.

Poikkeuksellisten DNA-tulosten takaa paljastui kaksi koirasutta. Auton alle Tohmajärvellä joulukuussa 2015 jäänyt yksilö oli kolmannen polven takaisinristeymä suteen. Kannanhoidollisella luvalla Pyhäjoella tammikuussa 2016 ammuttu yksilö oli toisen polven takaisinristeymä suteen. Ensin mainittu yksilö oli 4-vuotias uros ja jälkimmäinen 2-vuotias naaras.

Koirasusi on luokiteltu Suomessa haitalliseksi vieraslajiksi. Luke tulee käymään vanhan mikrosatelliittiaineiston huolellisesti läpi.

Uusi koirasusipaneeli erottaa koiran ja suden risteymät mikrosatelliittimenetelmää tarkemmin

Susien ja koirien perimän erot ovat pieniä, koska sudet ja koirat ovat geneettisesti eriytyneet toisistaan suhteellisen vähän aikaa sitten. Uusi koirasusipaneeli on kehitetty korostamaan susien ja koirien välisiä geneettisiä eroja. Koirasusipaneelia käytetään SNP-analyysissä.

Luonnonvarakeskuksen vuosittaiseen suden DNA-näytteiden lajimääritykseen on tähän saakka käytetty mikrosatelliittimarkkereita. Analyysit on tehty Turun yliopiston Evoluutiobiologian sovelluskeskuksessa. Tuore tutkimustulos osoittaa, että käytetty mikrosatelliittianalyysi erottaa koirasudet huonommin kuin koirasusipaneeli.

Luke käy läpi vanhat DNA-näytteet ja kehittää suden kannanarvioinnissa käytettävää DNA-analyysiä

- Kehitystyö on tervetullutta, kertoo Luken tutkimusprofessori Ilpo Kojola.

- Tieteelle on ominaista, että menetelmien kehittyessä tieto muuttuu ja täsmentyy. Koirasusipaneelin avulla kehitämme suden kannanseurantaan liittyvää risteymien tunnistamista.

Oulun yliopiston tutkimus tehtiin Saksassa olevalla laitteella, mutta samanlainen laite on vastikään hankittu maa- ja metsätalousministeriön tuella Lukeen. Luke tulee ottamaan menetelmän osaksi susikannan arviointia vuodesta 2022. Koirasusipaneeli tulee tulevaisuudessa olemaan Lukessa rutiinikäytössä.

Vanhoista näytteistä tullaan analysoimaan uudelleen ne yksilöt, jotka voivat ikänsä puolesta olla elossa tai nyt elossa olevien susiyksilöiden vanhempia. Myös vuosien 2016—2021 aikana kerätyistä ulostenäytteistä otetaan koirasusipaneeliin analysoitavaksi ne, jotka eroavat tyypillisestä suden profiilista. Vanhoja näytteitä päästään analysoimaan aikaisintaan, kun uusi laite on saatu Lukessa käyttöön.

Tuore SNP-tutkimus pähkinänkuoressa:

- Oulun yliopiston johtama kansainvälinen tutkimus, jonka tavoitteena oli kehittää DNA-menetelmä erottamaan entistä tarkemmin suden ja koiran risteymät.

- Koirasusipaneeli tarkoittaa risteymien tunnistamiseen valittuja 93 SNP-markkeria.

- Tutkimustulos on hyväksytty ja vertaisarvioitu, mutta artikkelia ei ole vielä julkaistu.

- Tutkimuksessa analysoitiin yhteensä 288 sutta Euroopan laajuisesti (näytteitä Suomesta 61 kpl, Venäjältä 4 kpl, Romaniasta 21 kpl, Saksasta 107 kpl, Italiasta 70 kpl ja Iberian niemimaalta 25 kpl).

- Suomesta toimitettiin näytteitä muun muassa metsästetyistä susista, museosusista ja tunnetuista koirasusista.

- Koira-aineistona tutkimuksessa käytettiin 314 koiran DNA-näytettä 55 eri rodusta.

- Risteymiksi epäiltyjä näytteitä oli koko tutkimuksessa yhteensä 12 kappaletta (3 kpl Saksasta, 1 kpl Romaniasta, 1 kpl Tšekistä ja 7 kpl Suomesta).

Live24magazine

08.05.2021European Council : The Porto declaration
08.05.2021Eurooppa-neuvosto: Porton julistus
08.05.2021Omfattande statistik om kostnadsstödet hittas på Statskontorets webbplats
08.05.2021Kattavat tilastot kustannustuesta Valtiokonttorin sivuilla
07.05.2021Lidl myy ensimmäisenä Suomessa koronakotitestejä - myynnissä kaikissa myymälöissä 14. toukokuuta
07.05.2021Kuljetusaloilla on tarve tiivistää yhteistyötä -Työantajapuoli haluaa muuttaa yksipuolisesti työehtoja kuljetusalojen työpaikoilla
07.05.2021Ratkaisevat viimeiset metrit
07.05.2021Apua perhe- ja parisuhdesolmujen avaamiseen
07.05.2021Suomi elää luovuudesta - kampanja alkaa tänään
07.05.2021Två år sedan Sverige hämtade hem barn från Al Hol - sedan dess har ingenting hänt
06.05.2021Oulu Pride ry: Petrus Schroderus vastuuseen vihapuheesta sosiaalisessa mediassa - rikosilmoitus ja kantelu
06.05.2021Vihreät nuoret: Turvallisempaa seksiä nuorille!
06.05.2021Seitsemän eduskuntapuoluetta yhdeksästä huomioi kuntavaaliohjelmassaan vammaiset
06.05.2021Hanhipeltokokeilu käynnistyy Pohjois-Karjalassa
05.05.2021Sukulan Pop Up - ravintola huikea menestys - Yli tuhat varausta muutamassa tunnissa
05.05.2021Vaccinationstäckningen bland yrkesutbildade personer inom hälso- och sjukvården varierar enligt yrkesgrupp och region
05.05.2021Terveydenhuollon ammattilaisten rokotuskattavuudessa on vaihtelua ammattiryhmittäin ja alueittain
05.05.2021Ikääntyneiden koronakuolemissa ja sairastuneiden kuolleisuudessa vähentymisen merkkejä viime kuukausina
05.05.2021Yrittäjät: Elpymispaketti pitää hyväksyä, rahan käyttöön tiukka valvonta
04.05.2021Turhautumisesta taidetta - ASDAMA HEL palaa taas
04.05.2021Korona innosti laajentamaan risteilyistä kotimaan junaraiteille
04.05.2021Lapset kuvaavat koronaa sairautena, joka muutti sosiaaliset normit
03.05.2021Monen nuoren kesätyö alkaa toukokuussa - Lidl sai yli 20 000 kesätyöhakemusta
03.05.2021Yhteiskunnan selkärangasta kannattaa pitää huolta
03.05.2021Asiantuntijoiden omistama ohjelmistotalo Luoto kasvoi vuonna 2020 yli 60 prosenttia - yhtiö ravistelee palveluyhtiöiden rakenteita
03.05.2021Nyt etsitään Vuoden maailmanparantajaa - luvassa 1 000 euron palkinto
03.05.2021Tahattomasti lapsettomat kokevat syrjintää työelämässä
01.05.2021Talentia tuomitsee työpaikkaväkivallan lastensuojelussa
30.04.2021Kauneutta ja liikkeen voimaa - Jaguar tukee Minna Tervamäen Taidetauko-projektia
30.04.2021Kehitysjärjestöt puoliväliriihestä: Leikkausten ei tule kohdistua maailman köyhimpiin ihmisiin
29.04.2021SKAL ry:n toimitusjohtajaksi Anssi Kujala
29.04.2021Koiran ja suden risteymien tunnistamiseen on kehitetty uusi menetelmä - osoitti vanhan DNA-analyysimenetelmän puutteen
28.04.2021Valtiokonttori: Yritykset kiinnostuneita kustannustuesta - ensimmäisenä päivänä 45 prosenttia enemmän hakemuksia kuin edellisellä kierroksella
28.04.2021#OmassaKuplassa-kampanja kehottaa viettämään vappua vain lähipiirin kesken
28.04.2021Selvitys: Lainsäädännön jälkiarvioinnit paremmin osaksi lainsäädännön kehittämistä
27.04.2021STM: Koronatodistuksen aikatauluista lisätietoa
27.04.2021Vappu on viemäritukosten sesonkiaikaa - syynä perinteinen vappuherkku
27.04.2021Kun kulkee metsässä; Pienin on usein vaarallisin
27.04.2021Oikeusministeriö: Osaamista viharikosten ja häirinnän vastaiseen työhön
23.04.2021THL on tarkentanut koronarokotusjärjestystä sote - henkilöstön osalta
23.04.2021Vammaispalvelulainsäädännön uudistamista valmistellaan vuoden 2021 aikana - osallistu kyselyyn
22.04.2021Muusikkojen liiton uusi Nyrkki - palkinto jaettiin tänään Aki Haurulle
22.04.2021Lastensuojelulain muutosehdotukset lausunnolla
22.04.2021Useimmat kuntavaaliehdokkaat ovat itse osallistuneet ammatilliseen koulutukseen
21.04.2021Virpi Salmen taidemeemikirja pilkkaa taiteen naiskäsityksiä
21.04.2021Mikael Jungner juontamaan televisio-ohjelmaa AlfaTV:lle
20.04.2021DNA toimittaa Ropo Capitalille kansainvälisen yritysverkon
20.04.2021Kasiluokkalaisista Suomen suurin oopperayleisö
20.04.2021Tulli torjui harmaata taloutta tehokkaasti vuonna 2020
19.04.2021" Sijainen "pureutuu ihmisen psyykeen ja kontrollin menettämisen pelkoihin
15.04.2021Hjallis Harkimon uusi tv-ohjelma herättää tunteita ja puhuu rahasta mielenkiintoisesti
15.04.2021THL:n koronakartta ja koronakartan avoimen datan rajapinta eivät päivity lauantaina 17. huhtikuuta huoltotöistä johtuvan käyttökatkon takia
15.04.2021Koronatartuntojen määrä selvästi laskenut - rajoitusten lieventäminen edellyttää suotuisan kehityksen jatkumista
13.04.2021THL:n asiantuntijat vastaavat yleisön kysymyksiin koronarokotuksista avoimessa verkkotilaisuudessa
12.04.2021Vuoden valokuvataidekirja 2020 on Teemu Mäen " Miten olla mies tai nainen tai jotain muuta? "
12.04.2021Aikakauslehtiviikko tavoitti yli 100 000 lukijaa
12.04.2021Terveydenhuollon työntekijöillä oli suhteessa saman verran koronatartuntoja kuin muilla työikäisillä vuonna 2020
07.04.2021Vanhempien lämpö suojaa nuorta rikollisuudelta ja psykopaattisilta piirteiltä
01.04.2021STM pyytää lausuntoja rokotusasetuksen muuttamisesta
01.04.2021Tornion Panimo Oy siirtää toimintansa Viroon
30.03.2021Oulun teatteri lomauttaa koko henkilöstön kuukaudeksi
30.03.2021Lähihoitajiksi opiskelevien osaaminen arvosanoilla mitattuna erittäin hyvää ja melko tasalaatuista - teoreettisessa osaamisessa kehitettävää
30.03.2021Takuueläke on hakematta noin 9 500:lla eläkeläisellä
30.03.2021Positiivisella luottotietorekisterillä halutaan torjua ylivelkaantumista
29.03.2021Tuomas Enbuske masennuksensa taustoista: "Halusin olla älykkäämpi kuin Jumala"
28.03.2021Ravintolat kiinni asiakkailta 18. huhtikuuta asti lähes koko maassa vakavan tautitilanteen vuoksi
28.03.2021Tartuntatautilain muutos mahdollistaa kaikenkokoisten tilojen sulkemisen koronaepidemian vuoksi
28.03.2021Valot sammuivat ympäri maailmaa - WWF:n Earth Hour rikkoi ennätyksiä osallistujamäärässä ja sosiaalisessa mediassa
27.03.2021Kuntien tarjoama maksuton ehkäisy vähentää teiniraskauksia, mutta nuorten yhdenvertaisuus ei toteudu
26.03.2021Lyhennetty LOST BOYS - elokuva on poistettu Yle Areena -palvelusta uuden ikärajaluokituksen seurauksena
25.03.2021Lauri Tähkän Toreilta Töölöön - kiertueen konsertit siirtyvät syyskuulle 2021
25.03.2021Tässä ovat vuoden 2020 parhaat äänikirjat
25.03.2021Kuopiossa vahvistetaan korona-arjessa jaksamista yhteisöllisesti urheiluseurojen kanssa
24.03.2021Reserviupseeriliitto: Lyijyammusrajoitukset vaarantavat maanpuolustusta
24.03.2021Korkein hallinto-oikeus: Kaupungilla oli oikeus purkaa lehtorin virkasuhde painavasta syystä
23.03.2021Tampereen elokuvajuhlat ensimmäistä kertaa verkossa - ohjelmistoa katsottiin yli 60 000 kertaa
23.03.2021Valtaosa suomalaisista pitää Suomen tupakkapolitiikan tavoitetta epärealistisena - tupakoinnin haittojen vähentämiseen kaivataan lisää tietoa ja keinoja
23.03.2021Kuopiolaisen Who Cares - järjestön webinaarit valtakunnallisesti suosittuja
22.03.2021Suojellaan Lapsia ry:n uusi Turvallisesti #Digiliikenteessävideo muistuttaa aikuisia lasten digiturvataitojen tukemisen tärkeydestä
21.03.2021Mattssonin huippuveto Oskarin Uintien kovin suoritus - Khalili hurjasteli parauinnin SE:n
21.03.2021Suomen Uimaliitto: Matti Mattsson huippuiskussa kisakauden avauksessaan - ui uuden Suomen ennätyksen
21.03.2021SDP:n Riitta Mäkinen: Lasten ja nuorten mielenterveyteen lisäresursseja
18.03.2021Stadi vs. Lande -ohjelman uusi kausi alkaa MTV3-kanavalla 14. huhtikuuta - kaudella tehdään harmillista historiaa
18.03.2021STM pyytää lausuntoja huumausainelain muutoksista - hampun viljelyn asemaa halutaan selkiyttää
18.03.2021Ulkoministeriö: Al-Hol -tehtävän kustannukset tähän mennessä noin 395 000 euroa
17.03.2021Peppi Pitkätossu on ensimmäinen Seinäjoen kaupunginteatterin striimattava esitys
15.03.2021Neljäsosa peruskoulujen ja toisen asteen oppilaitosten henkilöstöstä arvioi työkykynsä heikentyneeksi
13.03.2021Lumikuningatar-jääshow hakee esityksiin kymmeniä taitoluistelijoita ja jääkiekkoilijoita avoimella haulla
12.03.2021Koko vuosi koronaa - Kerro SKS:lle, miltä pandemian jatkuminen tuntuu
12.03.2021Vuosipäivänä käynnistyvä kampanja nostaa esille tapahtuma-alan äänettömän hädän
08.03.2021Tulli paljasti vuonna 2020 yli 6 600 tullirikosta - rikostorjunnan yhteiskunnallinen vaikuttavuus merkittävä
07.03.2021Demarinuoret: Faktat tiskiin vaalien siirtämisestä!
07.03.2021Kannanotto: Oi muistatko vielä sen virren, jota Koronakeväänä laulettiin?
05.03.2021Tutkimus: Lemmikkikoira muokkaa kodin mikrobistoa runsaammaksi ja monipuolisemmaksi
05.03.2021Aluehallintovirasto valvoo tartuntatautilain ja alkoholilain noudattamista tehostetusti tulevana viikonloppuna
05.03.2021Kiintiöpakolaistilastot 2020 julki - korona vaikutti valintojen järjestelyihin
03.03.2021Kansanedustajat Heinäluoma ja Ovaska: Freelancereiden tukemisen rinnalla varmistettava kulttuurialan työllistäjien tilanne
03.03.2021Vihreät nuoret: Hallitus, opiskelijoiden mitta on täynnä!
02.03.2021Kirjailijat antavat teoksilleen äänensä radiossa
26.02.2021Kaikki EU:n ulkopuolelta toimitettavat verkkokauppaostokset on tullattava heinäkuusta alkaen

Näytä lisää »